Danton Boller est né en 1972 à Gary (Indiana). Il y passe son enfance jusqu'à ce que sa famille s'installe en Californie lorsqu'il avait 12 ans.

Danton Boller commence la basse électrique à l'âge de 10 ans, mais ce n'est qu'une fois entré au collège qu'il commence à sérieusement envisager de faire de la musique son métier. C'est également à cette période qu'il commence à s'intéresser au jazz.En 1990, il se met à la contrebasse, ayant pour professeur "Senator" Eugene J. Wright, ancien musicien du Dave Brubeck Quartet. En 1997, il reçoit le Shelly Manne New Talent Award de la Los Angeles Jazz Society. Cette même année, il décide de s'installer à New York pour poursuivre sa passion du jazz.

Danton a enregistré et joué sur scène avec les plus grands noms du jazz, parmi lesquels Bennie Wallace, Mulgrew Miller, Alvin Queen, Willie Jones III, Anthony Wilson,  Roy Hargrove, Adam Rafferty,  Eric Person & Meta Four, Greg Glassman, Jon Fishman, Matt Munistari's Brock Mumford, Robert Glasper, Ronnie Mathews, Matt Otto, et le Village Vanguard Orchestra.

En 1998, il commence à travailler sur un projet de musique expérimentale appelé Exegesis, avec le guitariste Nick Demopolous. Exegesis se composie de morceaux originaux comprenant des instruementations acoustiques et électroniques. Le groupe a souvent joué sur les scènes de New York, avant de s'exporter à l'interantional. En 2003, Exegesis a été programmé dans le cadre du prestigieux Montreux Jazz Festival.